Besmetting
Besmetting gebeurt door een steek van besmette muggen. Als een besmet persoon door een mug wordt gestoken, kan die mug vervolgens andere mensen besmetten met het virus. Mensen kunnen elkaar niet besmetten met de ziekte. De mug broedt in zoet, stilstaand en schaduwrijk water. Rijstvelden zijn dus een ideale broedplaats.
Japanse encefalitis komt alleen voor in Zuid- en Zuidoost-Azië (van India tot Japan) en het uiterste noordoosten van Australië. Het risico op Japanse encefalitis is doorgaans laag voor reizigers. Het risico wordt wel groter als men langdurig of frequent in de risicogebieden verblijft of als men op het platteland verblijft waar veel varkens worden gehouden. Zie kaart.